В статье проанализированы финансовые показатели инновационного развития системообразующих отраслей экономики РФ, в частности – объем инвестиций в основной капитал предприятий, расходы на НИОКР. Условия 2022 г. и 2023 г. (разрыв хозяйственных связей, принятие экономических санкций, колебания курсов валют, рост ключевой ставки) не способствуют при прочих равных условиях стимулированию инвестиций в инновационное развитие отраслей российской экономики. Для привлечения финансовых ресурсов системообразующими предприятиями, повышения их инновационности, а как следствие – конкурентоспособности продукции, эффективности финансово-хозяйственной деятельности предлагается формирование нового подхода к кредитованию системообразующих предприятий. Авторами изучена внедряемая с 2022 г. система льготного кредитования, ее особенности и потенциальное влияние на инновационное развитие отраслей.