Трансформация структуры сельскохозяйственного производства в условиях внешнеэкономической турбулентности и технологических сдвигов становится ключевым фактором устойчивости региональных аграрных систем. В регионах Уральского федерального округа, сочетающих индустриальный профиль экономики с значимым сельским хозяйством, структурные изменения в аграрном секторе опосредуются воздействием государственной политики, институциональных ограничений и различий в природно-климатическом потенциале. Цель статьи состоит в выявлении направлений и факторов трансформации структуры сельскохозяйственного производства в регионах Уральского федерального округа под воздействием инструментов государственного регулирования. В рамках исследования уточняется содержание понятия трансформации структуры сельскохозяйственного производства как совокупности количественных и качественных изменений в соотношении отраслей растениеводства и животноводства, организационно-хозяйственных форм и технологической укорененности производства. Применяются методы динамического и сравнительного анализа, индексный подход к оценке структурных сдвигов, а также кластеризация регионов по совокупности показателей структурной модернизации. Показано, что в регионах Уральского федерального округа сохраняются различия по направлениям трансформации: в одних субъектах Российской Федерации усиливается специализация на зерновом и масличном растениеводстве, в других возрастает значимость животноводства и кормовой базы. Выявлено, что государственное регулирование через перераспределение субсидий, поддержку малых форм хозяйствования и стимулирование инвестиций в цифровизацию аграрного производства способствует формированию более устойчивых структур, сочетающих крупнотоварный и семейный секторы. Научная новизна работы заключается в институционально ориентированной количественной оценке структурных изменений сельского хозяйства Уральского федерального округа и выделении сочетаний мер государственной политики, связанных с ускорением структурной модернизации.