В условиях глобальной цифровой трансформации и формирования гиперконкурентной цифровой экономики для стран Евразийского экономического союза (ЕАЭС) актуализируется проблема адаптации системы высшего образования. Необходимость в разработке инструментов учета, которые позволяют обосновывать финансовые приоритеты и оценивать экономическую результативность принимаемых решений возникает в контексте ограниченности бюджетных ресурсов и разнообразия направлений инвестирования. Цель исследования – разработка и апробация методики комплексной оценки влияния цифровой трансформации вузов на экономические показатели. Методология исследования основывается на экономическо-статистическом анализе показателей человеческого капитала и инновационного развития стран ЕАЭС, тенденций финансирования высшего образования и сравнительный анализ заработной платы IT-специалистов стран ЕАЭС. Как показали результаты исследования, существование различий в доходах выпускников по принципу владения цифровыми навыками. Также была выявлена взаимосвязь объемов государственного финансирования на образование и показателей человеческого развития и инноваций. Авторский интегральный показатель может быть использован как инструмент управленческого учёта для обоснования приоритетов финансирования, оценки эффективности затрат и мониторинга результатов цифровой трансформации высшего образования в странах ЕАЭС. Исследование вносит вклад в понимание механизмов формирования рынка труда, функционирующих в условиях новой цифровой реальности, а также служит основой для разработки эффективной государственной политики в сфере образования и занятости.